More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1214 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
439 aa  882    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  73.86 
 
 
438 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  69.7 
 
 
436 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  70.16 
 
 
436 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  68.34 
 
 
436 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  68.56 
 
 
436 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  68.56 
 
 
436 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  61.73 
 
 
436 aa  554  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 
440 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  47.88 
 
 
449 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  46.45 
 
 
436 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  46.68 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 
436 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  44.62 
 
 
439 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  47.48 
 
 
439 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  45.41 
 
 
436 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  46.51 
 
 
444 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  44.85 
 
 
438 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
434 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  46.14 
 
 
440 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
434 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  46.81 
 
 
438 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
436 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  45.87 
 
 
437 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  45.87 
 
 
437 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  45.27 
 
 
428 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 
434 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
434 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  46.24 
 
 
433 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  45.23 
 
 
448 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
434 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 
435 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  45.29 
 
 
434 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  47.85 
 
 
432 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 
447 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 
436 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
427 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 
434 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  46.3 
 
 
463 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  46.48 
 
 
453 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 
452 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  45.91 
 
 
440 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.9 
 
 
442 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 
437 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 
434 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  46.26 
 
 
453 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
436 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  46.27 
 
 
436 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 
443 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 
442 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 
432 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 
442 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 
442 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 
443 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  44.67 
 
 
442 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 
443 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  44.67 
 
 
442 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  46.27 
 
 
437 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 
442 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
437 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.91 
 
 
430 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  44.27 
 
 
433 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  43.47 
 
 
441 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 
439 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 
431 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  46.91 
 
 
429 aa  363  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  46.67 
 
 
437 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
439 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 
445 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
439 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.98 
 
 
427 aa  360  2e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  45.1 
 
 
434 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 
424 aa  359  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  46.03 
 
 
434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 
428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 
431 aa  355  6.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  43.96 
 
 
436 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 
444 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 
433 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 
438 aa  353  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  44.04 
 
 
440 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
442 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  44.3 
 
 
469 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 
438 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 
442 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 
429 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  46.68 
 
 
450 aa  349  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 
439 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 
430 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  43.07 
 
 
449 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  46.27 
 
 
436 aa  348  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 
432 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 
432 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>