More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3010 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
440 aa  881    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  70.64 
 
 
434 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  70.64 
 
 
434 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  69.04 
 
 
434 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  69.04 
 
 
434 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  69.04 
 
 
434 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  69.04 
 
 
434 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  69.04 
 
 
434 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  68.42 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  68.58 
 
 
434 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  65.67 
 
 
433 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  67.81 
 
 
439 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  68.35 
 
 
434 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  64.07 
 
 
437 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  64.07 
 
 
437 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  64.76 
 
 
436 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  61.56 
 
 
435 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  61.7 
 
 
433 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  63.01 
 
 
436 aa  529  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  60.96 
 
 
439 aa  528  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  59.13 
 
 
436 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  59.68 
 
 
436 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  63.62 
 
 
450 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  63.47 
 
 
437 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  59.23 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  59.14 
 
 
447 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  57.33 
 
 
449 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  58.12 
 
 
436 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  63.68 
 
 
437 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  57.67 
 
 
436 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  58.92 
 
 
448 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  62.08 
 
 
449 aa  502  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  57.92 
 
 
440 aa  501  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  57.05 
 
 
442 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  60.41 
 
 
436 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  61.33 
 
 
436 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  56.82 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  56.6 
 
 
442 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  56.25 
 
 
443 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  57.05 
 
 
442 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  56.73 
 
 
443 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  55.95 
 
 
452 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  56.25 
 
 
443 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  57.18 
 
 
438 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  61.96 
 
 
436 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  58.05 
 
 
439 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  63.24 
 
 
437 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  58.05 
 
 
439 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  56.83 
 
 
453 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  57.05 
 
 
453 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  55.68 
 
 
438 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  56.31 
 
 
444 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  57.82 
 
 
439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  57.49 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  57.27 
 
 
442 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  55.61 
 
 
445 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  57.95 
 
 
438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  57.18 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  56.95 
 
 
436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  54.24 
 
 
448 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  54.02 
 
 
448 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  47.52 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  47.03 
 
 
436 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  45.85 
 
 
436 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  47.95 
 
 
439 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.91 
 
 
436 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 
436 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  46.44 
 
 
436 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  45.91 
 
 
439 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  50 
 
 
452 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  44.92 
 
 
436 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  48.99 
 
 
437 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 
428 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  44.16 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 
438 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 
438 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  43.55 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  47.48 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0011  homoserine dehydrogenase  53.83 
 
 
466 aa  356  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  49.65 
 
 
429 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
437 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  44.78 
 
 
423 aa  350  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  46.14 
 
 
432 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.75 
 
 
427 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  45.91 
 
 
438 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  46.24 
 
 
445 aa  346  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  44.22 
 
 
435 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 
434 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.95 
 
 
427 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 
441 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>