More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0217 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 422 aa  854    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  72.51 
 
 		 420 aa  619  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0834  homoserine dehydrogenase  73.7 
 
 		 420 aa  608  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0293  homoserine dehydrogenase  70.92 
 
 		 422 aa  578  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  63.27 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  62.41 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  62.09 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0145  homoserine dehydrogenase  62.09 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0164  homoserine dehydrogenase  62.09 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1904  homoserine dehydrogenase  58.53 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  45.75 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  44.22 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  44.22 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  44.01 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 436 aa  338  9e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  44.63 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  45.04 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 442 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 443 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  44.04 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  44.01 
 
 		 436 aa  328  8e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 440 aa  328  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  43.29 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.44 
 
 		 444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  43.95 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  45.17 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  42.6 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  47.21 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 438 aa  319  7e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 441 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 441 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 		 447 aa  318  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.59 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 430 aa  315  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  42.33 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  41.75 
 
 		 444 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  42.98 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  43.86 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  40.74 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 438 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 		 436 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.02 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 436 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 442 aa  302  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>