More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0145 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0145  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 415 aa  836    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0164  homoserine dehydrogenase  97.59 
 
 		 415 aa  788    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  98.55 
 
 		 415 aa  826    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  70.19 
 
 		 417 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  63.83 
 
 		 420 aa  541  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  62.09 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0834  homoserine dehydrogenase  62.86 
 
 		 420 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0293  homoserine dehydrogenase  63.74 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  57.72 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1904  homoserine dehydrogenase  54.29 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  44.25 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 441 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.63 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  43.98 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 442 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  40.74 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  40.74 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 442 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 442 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.14 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  41.25 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  43.13 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  41.01 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.96 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  42.65 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 438 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 449 aa  316  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 440 aa  315  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  44.38 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  40.93 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 442 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 442 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 442 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 442 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 442 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 442 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 442 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  43.73 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  41.73 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  42.65 
 
 		 448 aa  312  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  42.22 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  40.98 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  47.06 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 		 452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  46.15 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.6 
 
 		 440 aa  302  9e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 441 aa  299  5e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.47 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  42.19 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  38.85 
 
 		 438 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 436 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.06 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 		 438 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 437 aa  289  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 		 437 aa  288  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>