More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1414 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 417 aa  834    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  70.19 
 
 		 415 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0145  homoserine dehydrogenase  70.19 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0164  homoserine dehydrogenase  70.19 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  61.37 
 
 		 420 aa  524  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  62.41 
 
 		 422 aa  514  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  57.96 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0834  homoserine dehydrogenase  62.23 
 
 		 420 aa  497  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0293  homoserine dehydrogenase  61.7 
 
 		 422 aa  488  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1904  homoserine dehydrogenase  54.61 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.85 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  43.39 
 
 		 436 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  43.96 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 442 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  44.23 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  44.23 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 440 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 442 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  45.62 
 
 		 450 aa  332  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 443 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  46.74 
 
 		 427 aa  332  7.000000000000001e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 434 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 436 aa  332  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  43.39 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.43 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  40.89 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40.79 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.16 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  41.26 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  41.72 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  41.96 
 
 		 436 aa  322  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  40.56 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  40.56 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 441 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 435 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  40.56 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  43.2 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 449 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 438 aa  315  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  45.73 
 
 		 439 aa  315  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 440 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  44.56 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 449 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  41.36 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  45.33 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  42.75 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  38.75 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  41.72 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  42.4 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 430 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 452 aa  299  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  40.94 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.45 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.68 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  40.72 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>