More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0293 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0293  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 422 aa  850    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  71.33 
 
 		 420 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  70.92 
 
 		 422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0834  homoserine dehydrogenase  74.17 
 
 		 420 aa  599  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  62.32 
 
 		 423 aa  525  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  63.98 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  61.7 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0164  homoserine dehydrogenase  64.22 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0145  homoserine dehydrogenase  63.74 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1904  homoserine dehydrogenase  59.34 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 436 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  45.67 
 
 		 448 aa  325  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  43.39 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 444 aa  322  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 441 aa  318  9e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 442 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  43.83 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 449 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.31 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  43.55 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 436 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 436 aa  315  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 440 aa  312  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  43.83 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  45.32 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.51 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 442 aa  306  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 436 aa  305  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 434 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 453 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  45.05 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  41.07 
 
 		 434 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 450 aa  302  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 440 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.67 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>