More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1319 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 432 aa  872    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  60.37 
 
 		 435 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  56.26 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  55.47 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  55.4 
 
 		 430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  55.06 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  55.5 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  53.86 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  50.63 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  45.81 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  47.99 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.95 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  46.03 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  47.09 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  47.91 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  47.07 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  46.65 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  45.35 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  46.42 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  49.07 
 
 		 435 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  45.24 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  44.13 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  47.43 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  44.81 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  47.04 
 
 		 431 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  44.18 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  45.81 
 
 		 429 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 431 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.55 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  45.07 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  45.01 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  43.79 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  45.31 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  43.43 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  46.96 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  46.71 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  42.57 
 
 		 469 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  45.6 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 431 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 442 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 442 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.87 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  45.17 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  43.39 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.85 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 442 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 437 aa  349  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  43.96 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 448 aa  346  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 431 aa  345  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 434 aa  345  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.57 
 
 		 443 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  44.09 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  45.22 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  45.56 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  45.16 
 
 		 437 aa  342  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  42.59 
 
 		 434 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>