More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6156 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  77.34 
 
 		 435 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 437 aa  855    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  70.09 
 
 		 441 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  69.86 
 
 		 448 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  72 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  69.5 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  70.28 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  68.07 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  69.91 
 
 		 439 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  69.27 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  66.29 
 
 		 450 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  67.76 
 
 		 427 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  65.57 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  66.12 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  68.51 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  64.65 
 
 		 431 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  71.15 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  65.12 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  61.54 
 
 		 445 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  61.31 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  61.31 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  63.12 
 
 		 441 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  63.34 
 
 		 438 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  65.11 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  62.73 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  62.18 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  61.64 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  61.7 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  60.83 
 
 		 438 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  59.82 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  56.58 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  59.67 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  56.72 
 
 		 433 aa  421  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  59.26 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  57.91 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  50.36 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  46.62 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  47.43 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  50.35 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  53.08 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  46.06 
 
 		 430 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  45.94 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 431 aa  348  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 		 432 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  46.49 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 		 431 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.89 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 		 436 aa  329  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  46.05 
 
 		 440 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 436 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  46.14 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  40.61 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  45.54 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.92 
 
 		 439 aa  322  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 437 aa  319  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  44.01 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 440 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  47.42 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 		 444 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  42.38 
 
 		 469 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  46.29 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 429 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 		 440 aa  309  8e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  44.92 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  47.62 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1813  Homoserine dehydrogenase  52.49 
 
 		 425 aa  307  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 410 aa  306  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 440 aa  305  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 440 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>