More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  855    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  77.34 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  69.32 
 
 		 430 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  67.67 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  66.12 
 
 		 448 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  67.21 
 
 		 441 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  68.05 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  66.21 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  67.21 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  66.59 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  66.51 
 
 		 427 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  66.36 
 
 		 439 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  67.96 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  68.82 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  65.12 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  63.13 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  62.7 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  62.9 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  63.72 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  62.9 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  64.52 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  66.9 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  64 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  63.26 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  63.4 
 
 		 438 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  63.17 
 
 		 438 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  60.91 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  59.68 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  60.83 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  58.85 
 
 		 439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  59.44 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  54.25 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  58.1 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  58.08 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  49.89 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  55.56 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.52 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  48.11 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  46.7 
 
 		 456 aa  348  9e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  47 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  46.15 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  42.4 
 
 		 428 aa  336  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 431 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  44.06 
 
 		 432 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  46.25 
 
 		 427 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  44.16 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 		 436 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  45.58 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 469 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  45.77 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  43.91 
 
 		 440 aa  300  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  43.69 
 
 		 410 aa  296  7e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 441 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 441 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 431 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 436 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>