More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4153 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  835    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  72 
 
 		 437 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  69.32 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  70.47 
 
 		 437 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  70.21 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  68.76 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  70.02 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  68.94 
 
 		 431 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  67.84 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  68.54 
 
 		 430 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  68.53 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  69.43 
 
 		 437 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  67.92 
 
 		 428 aa  521  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  66.04 
 
 		 431 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  68.97 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  66.36 
 
 		 450 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  63.12 
 
 		 448 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  68.27 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  64.64 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  61.06 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  60.83 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  60.83 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  60 
 
 		 438 aa  461  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  59.95 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  59.27 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  60.42 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  60.19 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  58.53 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  57.76 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  55.3 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  59.36 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  58.84 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  60.42 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  56.05 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  48.94 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  50.8 
 
 		 438 aa  378  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.31 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  46.48 
 
 		 431 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  45.22 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.03 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  47.23 
 
 		 432 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  54.99 
 
 		 440 aa  352  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  46.67 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.93 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 436 aa  329  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  44.98 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  44.98 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.25 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  41.96 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  41.96 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  46.62 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  39.03 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  48 
 
 		 440 aa  315  7e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 424 aa  315  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  39.46 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 436 aa  312  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  44.95 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  42.64 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  42.15 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 436 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.64 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.62 
 
 		 438 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 441 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  45.15 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  43.15 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 463 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 448 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>