More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 455 aa  890    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  58.73 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  56.43 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  56.81 
 
 		 437 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  58.62 
 
 		 438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  56.35 
 
 		 450 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  54.48 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  56.04 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  55.05 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  56.52 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  57.34 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  54.97 
 
 		 445 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  54.73 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  54.13 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  54.73 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  54.57 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  56.19 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  55.63 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  55.32 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  55.2 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  56.01 
 
 		 433 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  55.53 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  54.36 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  55.5 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  54.97 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  52.76 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  54.5 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  53 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  55.28 
 
 		 437 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  53.69 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  52.64 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  54.38 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  54.46 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  47.83 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  51.24 
 
 		 440 aa  364  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  50.39 
 
 		 456 aa  353  5e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  45.61 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.16 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 430 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.04 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.86 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40.45 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  37.92 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  41.04 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  41.23 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.72 
 
 		 436 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  41.13 
 
 		 469 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  41.04 
 
 		 445 aa  306  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 432 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 		 417 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 		 417 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  37.64 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 		 438 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 429 aa  296  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  39.45 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  39.41 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  42.78 
 
 		 435 aa  289  9e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  40.29 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  41.27 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  41.16 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  39.06 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  38.72 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 		 431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>