More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2235 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  887    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  45.64 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 		 438 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 436 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  43.47 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.99 
 
 		 436 aa  348  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  43.27 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  45.17 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  40.99 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.93 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.67 
 
 		 440 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 449 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.18 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.99 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  44.18 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 442 aa  339  5e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  42.57 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  43.27 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 448 aa  339  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  42.51 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  43.28 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 434 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  41.35 
 
 		 441 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.57 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  43.47 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 463 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  42.57 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.47 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  42.57 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  43.08 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  42.6 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  40.91 
 
 		 428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 443 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  41.93 
 
 		 438 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 		 453 aa  325  9e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.21 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  44.82 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  40.81 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.67 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  40.67 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  42.65 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  39.28 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 429 aa  318  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  40.67 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  42.65 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  42.19 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 		 450 aa  315  9e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.65 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 423 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  40.93 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  41.65 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  42.33 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  40.79 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>