More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2298 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  858    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  85.42 
 
 		 441 aa  681    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  86.87 
 
 		 445 aa  726    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  86.64 
 
 		 445 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  86.64 
 
 		 445 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  93.84 
 
 		 438 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  71.89 
 
 		 448 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  69.86 
 
 		 438 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  63.17 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  62.18 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  61.75 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  61.52 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  59.63 
 
 		 448 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  59.54 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  61.06 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  60.51 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  58.47 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  60.74 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  61.5 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  60.56 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  57.47 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  58.58 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  58.74 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  59.49 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  54.97 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  59.95 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  59.49 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  57.31 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  56.52 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  58 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  57.83 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  58.31 
 
 		 438 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  58 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  56.35 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  47.86 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.29 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  51.49 
 
 		 438 aa  365  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  47.93 
 
 		 427 aa  362  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  53.46 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  43.68 
 
 		 435 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.68 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  45.71 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  47.11 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  40.67 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 436 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.04 
 
 		 428 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.93 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 431 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 431 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.29 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  43.91 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  43.96 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.79 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 440 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 431 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.31 
 
 		 436 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 429 aa  302  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  40.59 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  41.79 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  43.31 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 437 aa  296  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  37.22 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  38.96 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  43.47 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>