More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 440 aa  897    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  47.56 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  45.62 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 436 aa  345  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  48.03 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 431 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 436 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.63 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  41.72 
 
 		 432 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 439 aa  329  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 445 aa  326  5e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 436 aa  325  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 432 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.65 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.65 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  46.45 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.11 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 439 aa  319  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  40.83 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 		 439 aa  315  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  40.83 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 438 aa  315  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  42.02 
 
 		 418 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  44.01 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 448 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  39.54 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.45 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 		 437 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  44.37 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  44.55 
 
 		 430 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  38.74 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.08 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  44.71 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  43.55 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  39.13 
 
 		 431 aa  304  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>