More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01680 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 429 aa  871    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  72.03 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  47.65 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  47.43 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  46.84 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  48.67 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  44.86 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  47.83 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  45.33 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  45.1 
 
 		 432 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.69 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.54 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  41.14 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  40.91 
 
 		 442 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  40.91 
 
 		 442 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 		 429 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  45.13 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  47.99 
 
 		 431 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  41.14 
 
 		 442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.45 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41.36 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 438 aa  335  9e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  41.14 
 
 		 442 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 443 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 440 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 		 429 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  40.95 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 436 aa  328  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.01 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.09 
 
 		 436 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  41.43 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40.81 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  40.86 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  41.49 
 
 		 418 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 		 433 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  40.86 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  40.86 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 442 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  45.33 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  43.17 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  43.17 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  40.76 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 437 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  40.34 
 
 		 431 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.34 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.34 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.34 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 435 aa  309  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  44.33 
 
 		 435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 441 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  42.93 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>