More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0280 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 427 aa  858    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  72.03 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  49.29 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  48.71 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  49.53 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  49.18 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  46.95 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  45.14 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  48.29 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  47.56 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.85 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 		 428 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  46.22 
 
 		 433 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  48.42 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  43.42 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 441 aa  360  3e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 432 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  43.29 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 436 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 440 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 436 aa  349  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.59 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.59 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.59 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 		 443 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  46.85 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  46.05 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 442 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 444 aa  345  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 		 436 aa  345  8.999999999999999e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 429 aa  341  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 434 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  46.95 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 418 aa  335  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.39 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 433 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.74 
 
 		 434 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.07 
 
 		 448 aa  332  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  45.97 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  42.61 
 
 		 469 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  42.52 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 463 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  45.56 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  42.19 
 
 		 453 aa  329  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  42.19 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  45.73 
 
 		 437 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  39.87 
 
 		 452 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 431 aa  326  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>