More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1957 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  86.3 
 
 		 435 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  853    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  76.48 
 
 		 438 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  68.04 
 
 		 438 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  65.14 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  65.37 
 
 		 438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  59.91 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  53.12 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  52.66 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  56.58 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  52.19 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  51.73 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  56.38 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  56.38 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  53.6 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  53.66 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  55.79 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  54.52 
 
 		 429 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  47.89 
 
 		 427 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  49.62 
 
 		 432 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  47.17 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 430 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.92 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  45.56 
 
 		 436 aa  345  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  45.08 
 
 		 437 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  45.08 
 
 		 437 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.88 
 
 		 439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  43.13 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.95 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  42.53 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  44.73 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 		 436 aa  335  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 432 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  44.71 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.08 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  46.65 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.55 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 447 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  46.05 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  46.01 
 
 		 448 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  41.07 
 
 		 431 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 435 aa  325  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  45.89 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.35 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 		 434 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  47.02 
 
 		 437 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  44.95 
 
 		 449 aa  318  9e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  44.8 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  46.31 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 		 432 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.56 
 
 		 440 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.82 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  43.29 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.33 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  43.3 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.61 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  43.52 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  45.97 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  42.33 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  42.96 
 
 		 441 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.08 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  43.61 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  44.68 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 440 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  38.77 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>