More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11421 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  78.98 
 
 
433 aa  686    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  79.21 
 
 
433 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  79.45 
 
 
433 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
433 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  54.79 
 
 
438 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  54.79 
 
 
440 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  52.64 
 
 
438 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  54.17 
 
 
438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  52.76 
 
 
435 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  52.05 
 
 
435 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 
432 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 
432 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  48.96 
 
 
445 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 
433 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  48.72 
 
 
434 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 
469 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  47.55 
 
 
429 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 
429 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  40.92 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 
432 aa  312  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 
431 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  39.27 
 
 
431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 
431 aa  309  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.04 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 
430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
431 aa  305  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  38.57 
 
 
431 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 
429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  43.66 
 
 
418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 
431 aa  302  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.75 
 
 
431 aa  302  9e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 
431 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 
431 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 
431 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 
431 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 
439 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 
432 aa  300  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  38.33 
 
 
431 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  37.86 
 
 
431 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  39.29 
 
 
424 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 
437 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 
437 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 
431 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 
431 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 
428 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.2 
 
 
432 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
436 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  36.74 
 
 
438 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 
435 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 
436 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
431 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
437 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 
443 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
417 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
417 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
443 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  35.7 
 
 
444 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  37.91 
 
 
441 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 
436 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 
439 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 
436 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 
440 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 
437 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  35.43 
 
 
447 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 
431 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  34.62 
 
 
452 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 
435 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 
448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.47 
 
 
436 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 
449 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  37.47 
 
 
442 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 
436 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  35.03 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  37.15 
 
 
437 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 
428 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 
442 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  38.03 
 
 
437 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 
453 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 
425 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 
448 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  35.43 
 
 
436 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 
453 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  37.53 
 
 
436 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 
436 aa  280  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 
438 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  39.75 
 
 
449 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 
442 aa  279  8e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>