More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0786 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
425 aa  859    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  48.93 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 
428 aa  360  4e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 
431 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 
431 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 
431 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 
431 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 
431 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 
431 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 
431 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 
431 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  44.1 
 
 
431 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 
431 aa  342  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 
431 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 
431 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 
431 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 
432 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 
431 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  43.14 
 
 
431 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 
432 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  43.63 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  43.63 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 
428 aa  324  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.14 
 
 
431 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 
430 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 
432 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 
430 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 
432 aa  299  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40.25 
 
 
427 aa  296  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 
427 aa  296  6e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  39.16 
 
 
429 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 
441 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  40.86 
 
 
438 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 
418 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 
435 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 
431 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  39.11 
 
 
428 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 
438 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 
430 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.68 
 
 
428 aa  286  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  41.27 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 
426 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 
439 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 
440 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  41.04 
 
 
448 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 
433 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  39.33 
 
 
424 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 
441 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 
441 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 
436 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 
441 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 
438 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  39.85 
 
 
435 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 
438 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.06 
 
 
436 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  38 
 
 
441 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  39.9 
 
 
423 aa  276  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 
433 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  38.67 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.75 
 
 
437 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 
428 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 
440 aa  274  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 
433 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 
434 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 
434 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
442 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  45.57 
 
 
426 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.77 
 
 
438 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  45.57 
 
 
426 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 
437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  38.33 
 
 
436 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 
436 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  38.31 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.56 
 
 
436 aa  269  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 
463 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  37.86 
 
 
447 aa  269  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
442 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
442 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 
443 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 
430 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 
445 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  40.45 
 
 
435 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 
437 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 
437 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 
437 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 
441 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  38.38 
 
 
438 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 
438 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>