More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0506 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 428 aa  866    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  60.51 
 
 		 428 aa  554  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  55.63 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  44.5 
 
 		 425 aa  360  4e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  41.98 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  42.75 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 431 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 431 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  41.85 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 		 431 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  42.75 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 		 431 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  42.58 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  41.23 
 
 		 428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.39 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40.61 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  324  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.9 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  40.56 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  40.63 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  40.67 
 
 		 431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.09 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  39.8 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 447 aa  299  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 445 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 436 aa  298  9e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 438 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  39.01 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.19 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  38.59 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  38.13 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  38.28 
 
 		 436 aa  292  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 		 435 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  38.59 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  38.65 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  38.1 
 
 		 438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.28 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  39.14 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  39.14 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  37.86 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  37.59 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.59 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 430 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  37.56 
 
 		 437 aa  285  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 		 434 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  37.03 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 		 436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  38.74 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  40.51 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 434 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 		 434 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  39.01 
 
 		 430 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>