More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1280 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 428 aa  869    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  60.51 
 
 		 428 aa  554  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  50.93 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  43.1 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  41.75 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  41.26 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  41.26 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  41.26 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 431 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  41.02 
 
 		 431 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  41.02 
 
 		 431 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  40.89 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  41.13 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 432 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  40.75 
 
 		 432 aa  319  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 431 aa  315  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 431 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.96 
 
 		 431 aa  312  9e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  38.77 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 417 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 417 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 428 aa  302  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  37.23 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  38.41 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  39.75 
 
 		 418 aa  292  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  37.79 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  37.96 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 432 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  39.11 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.3 
 
 		 436 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  35.89 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  34.21 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  37.08 
 
 		 436 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  37.44 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  37.56 
 
 		 441 aa  272  8.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 436 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  38.28 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  37.91 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  35.1 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  36.63 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  37.68 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  36.51 
 
 		 438 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  37.53 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 		 434 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  37.29 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 431 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 435 aa  266  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  35.89 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.87 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  35.64 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  37.11 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.8 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  35.77 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  35.77 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 417 aa  263  6e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  37.78 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  36 
 
 		 440 aa  262  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  36.1 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  36.1 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  38.04 
 
 		 440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  36.63 
 
 		 427 aa  259  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  38.42 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>