More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1546 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
432 aa  873    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  48.93 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  41.98 
 
 
431 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  40.68 
 
 
431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 
431 aa  312  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 
431 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 
431 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 
431 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.67 
 
 
431 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 
431 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 
428 aa  310  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.75 
 
 
432 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 
431 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  40.59 
 
 
431 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  40.59 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  40.59 
 
 
431 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 
438 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 
417 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 
417 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 
431 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  38.41 
 
 
428 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 
432 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 
418 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  37.97 
 
 
430 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  38.6 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 
433 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 
427 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 
448 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  36.68 
 
 
429 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
437 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 
438 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.74 
 
 
438 aa  276  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 
432 aa  276  7e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.88 
 
 
437 aa  275  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  37.12 
 
 
439 aa  275  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 
447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 
436 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  38.79 
 
 
433 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  37.03 
 
 
438 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 
440 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 
424 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 
438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 
440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 
428 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
428 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  36.52 
 
 
444 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 
439 aa  266  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 
427 aa  266  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  36.13 
 
 
430 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  37.97 
 
 
445 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3015  Homoserine dehydrogenase  43.2 
 
 
398 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00421083  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 
442 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  35.77 
 
 
437 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  35.77 
 
 
437 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  38.1 
 
 
435 aa  262  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 
441 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 
442 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  36.48 
 
 
449 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 
442 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.02 
 
 
436 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  36.19 
 
 
430 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 
442 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 
436 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  39.8 
 
 
440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 
408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 
434 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  37.75 
 
 
436 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.03 
 
 
463 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 
436 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.39 
 
 
436 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  36.7 
 
 
448 aa  259  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  37.68 
 
 
430 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  35.77 
 
 
435 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 
432 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
438 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 
432 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 
442 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 
436 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 
438 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 
429 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 
435 aa  256  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  38.21 
 
 
434 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  34.86 
 
 
436 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  34.26 
 
 
442 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  35.27 
 
 
443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  34.67 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 
433 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>