More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1075 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 408 aa  834    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  48.11 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  47.8 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  47.48 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  47.48 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  44.04 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  47.81 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 		 431 aa  292  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  47.5 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  47.19 
 
 		 431 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  46.88 
 
 		 431 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  47.19 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  47.96 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  41.27 
 
 		 428 aa  272  6e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  36.23 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  36.93 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  37.22 
 
 		 429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 		 436 aa  245  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  36.91 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  40.26 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  40.63 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  39.25 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 430 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  36.65 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.41 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.15 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  38.29 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  39.42 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 437 aa  235  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  38.03 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.81 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  39.74 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  36.19 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 455 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  38.68 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  38.67 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  37.9 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 		 449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  37.27 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  37.58 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  35.92 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 440 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  36.22 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  36.02 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 437 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  37.86 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  39.88 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  32.87 
 
 		 447 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  34.92 
 
 		 437 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  34.92 
 
 		 437 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 436 aa  219  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  36.16 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  35.53 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  35.53 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  35.85 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  37.82 
 
 		 441 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>