More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1901 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
448 aa  879    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  72.06 
 
 
438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  69.37 
 
 
445 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  69.14 
 
 
445 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  69.14 
 
 
445 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  71.89 
 
 
438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  71.43 
 
 
438 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  71.66 
 
 
441 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  66.12 
 
 
435 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  65.27 
 
 
437 aa  504  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  63.19 
 
 
437 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  63.12 
 
 
430 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  61.89 
 
 
437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  60.47 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  60.69 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  61.12 
 
 
448 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  61.4 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  60.79 
 
 
439 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  62.21 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  60.61 
 
 
435 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  62.26 
 
 
439 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  55.94 
 
 
431 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  57.98 
 
 
428 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  57.93 
 
 
450 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  60.05 
 
 
434 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  54.82 
 
 
455 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  59.12 
 
 
436 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  57.08 
 
 
431 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  56.32 
 
 
438 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  55.13 
 
 
442 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  57.74 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  56.12 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  56.49 
 
 
439 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  56.94 
 
 
438 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  49.4 
 
 
432 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  46.39 
 
 
427 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  54.48 
 
 
440 aa  360  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.01 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 
435 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.73 
 
 
431 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  48.05 
 
 
438 aa  344  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 
430 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  45.76 
 
 
431 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  46.34 
 
 
441 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  52.74 
 
 
456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 
436 aa  326  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 
436 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.35 
 
 
428 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 
439 aa  319  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 
432 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 
436 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 
445 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 
440 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  36.74 
 
 
424 aa  312  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 
431 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 
432 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
431 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
431 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
431 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
431 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
431 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 
428 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 
438 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  40.74 
 
 
432 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  41.23 
 
 
469 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  46.17 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  37.41 
 
 
418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 
438 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 
441 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 
436 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  44.82 
 
 
427 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 
437 aa  298  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 
436 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 
417 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
436 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 
417 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  39.75 
 
 
433 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 
440 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 
442 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 
431 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.72 
 
 
448 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 
433 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 
439 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 
429 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 
435 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 
444 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 
430 aa  292  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 
440 aa  292  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 
431 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  43.19 
 
 
436 aa  292  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>