More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3041 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  87.73 
 
 		 432 aa  772    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 432 aa  872    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  72.66 
 
 		 431 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  69.77 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  69.77 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  69.77 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  69.77 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  69.77 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  69.77 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  69.53 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  69.53 
 
 		 431 aa  621  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  67.44 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  67.44 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  56.94 
 
 		 431 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  56.25 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  56.48 
 
 		 431 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  56.25 
 
 		 431 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  56.25 
 
 		 431 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  56.25 
 
 		 431 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  56.25 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  55.79 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  56.02 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  56.02 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  56.35 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  49.64 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  47.58 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  47.63 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  46.32 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  43.79 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 428 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  44.89 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 436 aa  342  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 434 aa  339  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 436 aa  338  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  42.26 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  41.39 
 
 		 441 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  41.96 
 
 		 429 aa  338  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  44.72 
 
 		 450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  43.29 
 
 		 418 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  41.43 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.16 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 439 aa  332  9e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 463 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  41.83 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  40.48 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  40.63 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 449 aa  328  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  41.45 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  44.11 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  45.56 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  41.25 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  43.54 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  43.54 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  43.54 
 
 		 445 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 442 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  38.77 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 424 aa  322  8e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 		 442 aa  322  9.000000000000001e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>