More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2809 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 437 aa  891    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.5 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 443 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.65 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.59 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 442 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 436 aa  332  9e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.08 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  41.74 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.43 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 445 aa  322  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  41.83 
 
 		 418 aa  322  8e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  40.89 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  41.36 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  39.25 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.56 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  41.09 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 		 440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 441 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 447 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 438 aa  309  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 441 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  40.9 
 
 		 432 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 432 aa  305  8.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  41.75 
 
 		 439 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  40.83 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 		 448 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  39.09 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  39.14 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.17 
 
 		 438 aa  299  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 432 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>