More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1230 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  861    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  72.06 
 
 		 448 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  69.86 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  69.41 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  68.89 
 
 		 445 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  68.66 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  68.66 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  69.35 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  62.7 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  62.73 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  61.7 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  61.2 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  61.43 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  60 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  62.21 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  60.74 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  60.56 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  59.48 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  58.9 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  57.6 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  59.4 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  59.18 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  59.23 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  59.25 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  62.44 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  58.33 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  54.02 
 
 		 455 aa  428  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  59.25 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  59.16 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  59.77 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  56.18 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  57.14 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  56.56 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  56.88 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  57.04 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  48.37 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  48.32 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  48.73 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.32 
 
 		 430 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  43.65 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 436 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  45.65 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  44.03 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  45.25 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  43.09 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  41.34 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 439 aa  326  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  41.11 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  44.08 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  44.06 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.4 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  44.71 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 417 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 417 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.9 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  43.15 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 436 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 		 418 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  43.61 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  39.45 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  43.38 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  43.38 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  43.58 
 
 		 435 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 429 aa  302  7.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  42.52 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 422 aa  296  6e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  43.08 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  38.86 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>