More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1607 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  881    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  55.95 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  54.76 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  49.89 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  51.95 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  51.03 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  50.69 
 
 		 450 aa  388  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  50.58 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  50.34 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  50.8 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  49.66 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  51.57 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  50.8 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  51.82 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  51.26 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  51.16 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  50.35 
 
 		 428 aa  363  4e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  49.54 
 
 		 445 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  49.65 
 
 		 439 aa  358  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  48.05 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  48.84 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  49.31 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  49.31 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  51.26 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 440 aa  349  7e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1230  Homoserine dehydrogenase  48.73 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  48.26 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  48.27 
 
 		 428 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  49.54 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  49.66 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  47.92 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  42.5 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3651  homoserine dehydrogenase  48.17 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  48.03 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.93 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2095  Homoserine dehydrogenase  46.93 
 
 		 439 aa  319  7e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000399593  normal  0.0872983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  41.18 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  41.01 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  41.18 
 
 		 432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 430 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.64 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  40.49 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.14 
 
 		 439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 436 aa  302  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 437 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  42.01 
 
 		 437 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 		 438 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  43.93 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 443 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  39.35 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 452 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 442 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>