More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2010 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  81.42 
 
 		 448 aa  711    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  81.19 
 
 		 448 aa  704    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 445 aa  896    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  58.47 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  58.88 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  57.98 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  58.43 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  57.75 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  57.75 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  58.43 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  57.3 
 
 		 434 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  57.53 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  58.87 
 
 		 450 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  54.16 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  55.98 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  55.48 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  58.65 
 
 		 434 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  53.93 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  54.93 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  55.73 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  55.61 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  54.61 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  55.83 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  55.83 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  56.73 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  52.88 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  57.51 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  56.13 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  52.2 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  51.99 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  52.89 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  52.21 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  53.24 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  50.76 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  53.23 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  50.76 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  51.21 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  50.76 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  51.43 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  51.9 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  54.29 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  54.27 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  57.43 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  50.55 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  50.33 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  52.31 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  54.29 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  52.11 
 
 		 440 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  51.12 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  55.08 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  51.35 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  56.78 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  55.37 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  52.34 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  53.69 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  52.3 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  50.22 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  53.04 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  51.61 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  51.03 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  51.21 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  51.21 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  49.1 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  49.1 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  44.99 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.07 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  44.71 
 
 		 437 aa  348  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 438 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  44.42 
 
 		 430 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  42.92 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.72 
 
 		 439 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 429 aa  332  8e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  42.83 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  43.22 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.65 
 
 		 438 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 437 aa  322  9.000000000000001e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.67 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 441 aa  316  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  43.04 
 
 		 418 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 423 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  42.44 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>