More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0011 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0011  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  901    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  56.76 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  50.79 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  50.56 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  50.89 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  50.22 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  50.22 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  49.66 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 		 449 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  47.87 
 
 		 436 aa  402  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  48.45 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  47.64 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  47.87 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  49.22 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  47.77 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  53.18 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  52.93 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  52.93 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  52.93 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  48.47 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  47.88 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  52.67 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  49.44 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  54.09 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  50.22 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  49.44 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  50.22 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  52.93 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  46.56 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  52.16 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  49.21 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  48.44 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  50.11 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  50.38 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  46.64 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  46.19 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  46.52 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  50.38 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  46.19 
 
 		 434 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  51.65 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  47.77 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  46.19 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  51.65 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  48.33 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  51.17 
 
 		 438 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  48.55 
 
 		 442 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  49.11 
 
 		 449 aa  362  9e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  50.89 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  46.2 
 
 		 450 aa  359  6e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  43.97 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0012  homoserine dehydrogenase  57.43 
 
 		 472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.728091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  47.99 
 
 		 437 aa  356  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  44.27 
 
 		 433 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 		 437 aa  356  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4155  homoserine dehydrogenase  57.75 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  49.11 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  46.65 
 
 		 439 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  47.64 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  47.63 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  51.15 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  45.84 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  46.74 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  51.76 
 
 		 430 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  44.07 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  45.33 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  40.99 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  44.12 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  40.88 
 
 		 448 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 448 aa  302  9e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  38.85 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  43.76 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  39.1 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  37.22 
 
 		 431 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.66 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  36.06 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 436 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 444 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  56.39 
 
 		 429 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 440 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 439 aa  292  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>