More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1959 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 418 aa  850    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  59.38 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  57.87 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  54.32 
 
 		 400 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  44.79 
 
 		 418 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 		 431 aa  332  9e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  40.75 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  40.39 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.03 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  41.31 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 432 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  36.93 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  39.19 
 
 		 431 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  39.19 
 
 		 431 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  36.57 
 
 		 436 aa  292  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3015  Homoserine dehydrogenase  44.75 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00421083  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  38.95 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  39.19 
 
 		 431 aa  289  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  36.96 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  39.19 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  36.11 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  39.06 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  38.72 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 432 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  36.73 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  37.47 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 		 442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  38.31 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  36.24 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  36.64 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  37.64 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  37.79 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.41 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  36.57 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 		 439 aa  279  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  37.44 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  37.56 
 
 		 440 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  35.92 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  35.53 
 
 		 448 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  39.47 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  34.08 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.7 
 
 		 431 aa  273  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  36.62 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  34.94 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  37.96 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  36.15 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  37.88 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.85 
 
 		 431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  37.88 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  35.7 
 
 		 438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  35.57 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  35.43 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  35.51 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  41.56 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  41.56 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  37.47 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  35.21 
 
 		 442 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  35.21 
 
 		 442 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>