More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1376 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 415 aa  841    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  61.74 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  58.35 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  50.48 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  46.06 
 
 		 432 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  52.39 
 
 		 418 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  44.19 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  44.63 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  43.56 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.39 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  42.02 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  44.47 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 432 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  42.2 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.4 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  37.96 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  45.03 
 
 		 441 aa  292  8e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 431 aa  289  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  37.59 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  37.59 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  37.59 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.93 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 		 436 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.69 
 
 		 436 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 		 442 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  36.89 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.78 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 442 aa  282  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  41.83 
 
 		 440 aa  282  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  42.19 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  36.38 
 
 		 434 aa  280  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 		 436 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.21 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  37.97 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.03 
 
 		 443 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  39.55 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  37.56 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 445 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  38.04 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  36.49 
 
 		 436 aa  276  4e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 		 440 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.13 
 
 		 432 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  39.83 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  39.83 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  37.26 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  39.2 
 
 		 438 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  36.81 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  37.98 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  36.57 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.53 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 435 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  39 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  41.43 
 
 		 439 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>