More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2086 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  711    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  81.13 
 
 		 353 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  45.35 
 
 		 353 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  46.2 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  45.45 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  43.66 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 		 349 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  39.88 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  39.71 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  38.78 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  39.36 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  38.71 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  44.22 
 
 		 359 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  44.35 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  43.77 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  43.2 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  43.53 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  45.64 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  37.87 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  45.22 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  46.09 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  34.2 
 
 		 441 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  35.38 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  36.12 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  35.54 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  31.16 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  34.1 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  34.1 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  30.86 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.52 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  33.81 
 
 		 431 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  30.61 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  30.61 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  36.8 
 
 		 432 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.52 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  34.96 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 		 347 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 431 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  38.2 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  33.52 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  38.9 
 
 		 448 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 436 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 		 347 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  33.52 
 
 		 431 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  31.07 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  31.07 
 
 		 346 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  35.76 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  34.74 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  34.74 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  34.21 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  35.19 
 
 		 439 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 		 439 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  35.05 
 
 		 426 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 440 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  42.62 
 
 		 428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  38.62 
 
 		 456 aa  179  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 436 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.52 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  33.73 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  35.61 
 
 		 432 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 410 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 427 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  34.33 
 
 		 436 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>