More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1389 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  80.99 
 
 
426 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
426 aa  855    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
426 aa  855    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  46.92 
 
 
432 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  50.79 
 
 
431 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  50.79 
 
 
431 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  50.64 
 
 
431 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  50.47 
 
 
431 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  48.09 
 
 
431 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  50.16 
 
 
431 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  49.68 
 
 
431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  49.68 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  49.68 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  49.68 
 
 
431 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  50 
 
 
431 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  50 
 
 
431 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  49.68 
 
 
431 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  49.68 
 
 
431 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  49.68 
 
 
431 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  46.38 
 
 
432 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  48.9 
 
 
430 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  47.6 
 
 
429 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  48.58 
 
 
431 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  47.95 
 
 
432 aa  295  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 
427 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.75 
 
 
428 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  48.73 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.94 
 
 
440 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 
436 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  43.82 
 
 
443 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.07 
 
 
439 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 
427 aa  275  8e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  43.24 
 
 
443 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  47.1 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  42.78 
 
 
424 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 
436 aa  272  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  42.94 
 
 
442 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  42.94 
 
 
442 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  45.57 
 
 
425 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  42.65 
 
 
442 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  45.57 
 
 
414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 
435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 
437 aa  269  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 
437 aa  269  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  46.84 
 
 
432 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.08 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 
442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  43.6 
 
 
432 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.07 
 
 
439 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  43.93 
 
 
435 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  43.6 
 
 
432 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 
428 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  41.35 
 
 
436 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 
444 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 
442 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 
428 aa  263  4e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 
436 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.94 
 
 
443 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 
442 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 
436 aa  262  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 
436 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  44.03 
 
 
429 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.83 
 
 
436 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 
449 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 
427 aa  260  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 
436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 
437 aa  259  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.35 
 
 
440 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 
436 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  44.03 
 
 
441 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 
436 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  40.35 
 
 
433 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 
441 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  40.59 
 
 
438 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 
436 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  40.57 
 
 
438 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 
434 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  44.62 
 
 
438 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  40.63 
 
 
445 aa  256  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 
447 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  39.47 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 
435 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  41.62 
 
 
420 aa  253  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  41.54 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 
434 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 
433 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 
440 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.25 
 
 
436 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  44.3 
 
 
430 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 
434 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 
434 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>