More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0481 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  655    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  58.95 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  59.88 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  58.51 
 
 		 328 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  55.9 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  45.45 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  46.23 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  44.41 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  43.2 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  43.52 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  42.51 
 
 		 353 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 353 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  41.69 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  37.04 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 		 418 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 431 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 		 444 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 418 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  35.49 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 441 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 		 427 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  34.85 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.03 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  36.13 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.12 
 
 		 428 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.55 
 
 		 436 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  37 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  44.4 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 438 aa  185  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 440 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  36.13 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 432 aa  184  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 436 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  37.92 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  36.04 
 
 		 436 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  38.77 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  37.58 
 
 		 441 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.92 
 
 		 431 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  39.92 
 
 		 436 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.92 
 
 		 431 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 440 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 		 425 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 		 440 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  37.92 
 
 		 440 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 440 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1016  homoserine dehydrogenase  43.33 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00327317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  37.15 
 
 		 440 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  38.49 
 
 		 439 aa  178  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>