More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2515 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
319 aa  619  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  85.58 
 
 
315 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  71.75 
 
 
319 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  70.48 
 
 
317 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  70.34 
 
 
328 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 
328 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  47 
 
 
328 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  43.93 
 
 
331 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 
330 aa  235  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 
328 aa  231  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 
328 aa  225  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 
337 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  37.08 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  35.76 
 
 
337 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.45 
 
 
336 aa  178  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 
436 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  34.73 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  34.48 
 
 
431 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
429 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
433 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 
431 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 
431 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.49 
 
 
436 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 
440 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 
423 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 
431 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 
431 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 
431 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  35.94 
 
 
739 aa  153  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 
431 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  36.62 
 
 
441 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  36.23 
 
 
349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 
431 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  38.13 
 
 
431 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 
428 aa  152  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  34.77 
 
 
428 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
347 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  33.97 
 
 
431 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  35.13 
 
 
431 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  36 
 
 
441 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  34.57 
 
 
431 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 
439 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 
347 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 
336 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
417 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
417 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 
436 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 
410 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
431 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
431 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
431 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 
432 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
431 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
431 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
431 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  40.08 
 
 
425 aa  149  9e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 
456 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  35.2 
 
 
720 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 
438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  37.12 
 
 
440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  35.38 
 
 
439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  38.91 
 
 
439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  31.56 
 
 
424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 
431 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.96 
 
 
431 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.48 
 
 
436 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 
438 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  37.27 
 
 
437 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 
422 aa  145  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  43.05 
 
 
432 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 
428 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 
448 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  34.07 
 
 
431 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 
439 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 
435 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  39.42 
 
 
438 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
441 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 
436 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 
440 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  35.44 
 
 
417 aa  142  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  29.66 
 
 
441 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 
418 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  38.27 
 
 
455 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  30.6 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  34.7 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 
432 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 
437 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 
440 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>