More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1354 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  651    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  67.18 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  64.51 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  63.27 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  58.51 
 
 		 328 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  41.02 
 
 		 337 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  41.62 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  41.54 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  43.17 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  43.43 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  44.51 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  43.3 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  41.99 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  36.61 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 431 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  36.61 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 		 432 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  36.23 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 436 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 418 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  38.72 
 
 		 436 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.04 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 		 439 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  37.92 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 436 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  37.08 
 
 		 435 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  34.14 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  36.02 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.81 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  34.23 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  34.23 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  46.22 
 
 		 440 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.17 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.17 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 431 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 		 436 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  36.15 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 431 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  37.27 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  45.65 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.85 
 
 		 431 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  35.28 
 
 		 431 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 428 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  34.85 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  47.11 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 439 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 441 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 440 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 428 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 427 aa  172  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 431 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 439 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 426 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 		 431 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 		 431 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 		 431 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 440 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 		 410 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 431 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  35.49 
 
 		 431 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 431 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 431 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  35.35 
 
 		 439 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 431 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 428 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 428 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  34.14 
 
 		 427 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  34.33 
 
 		 430 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 		 431 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 448 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  34.44 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  40.08 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>