More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1087 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  662    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  67.07 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  50.3 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  55.45 
 
 		 335 aa  329  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  51.98 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 337 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  50.15 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  49.85 
 
 		 337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  49.85 
 
 		 328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  48.32 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  45.45 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  43.79 
 
 		 315 aa  251  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  43.93 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 317 aa  231  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 353 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  37.87 
 
 		 431 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.99 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.1 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 		 347 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  38.42 
 
 		 436 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.42 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 347 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  35.76 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 436 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 438 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 431 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.67 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 431 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 431 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 439 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  38.18 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 439 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.81 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 		 441 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  43.63 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 440 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  35.99 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 428 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 444 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  44.59 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 		 441 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  33.92 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  35.1 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 420 aa  176  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  42.41 
 
 		 431 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 441 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 441 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  35.86 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 438 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>