More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3560 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  62.64 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  61 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  60.12 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  49.85 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  50.44 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  49.85 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  44.02 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  42.27 
 
 		 353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  36.69 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  39.4 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  36.61 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 436 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  39.16 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  37.68 
 
 		 441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  42.64 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 		 439 aa  175  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  36.29 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  33.93 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 439 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 439 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 440 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  32.87 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  33.9 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  32.96 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  38.4 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 		 435 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  29.45 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  32.34 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  29.45 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  40.07 
 
 		 435 aa  162  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  29.6 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  29.6 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 441 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  29.89 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  37.45 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  29.31 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  29.33 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  40.15 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  41.45 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  29.31 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  32.77 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  39.54 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  34.88 
 
 		 438 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  33.99 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  32.06 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  41.23 
 
 		 433 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  31.04 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  34.53 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  36.13 
 
 		 441 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  34.45 
 
 		 353 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  30.62 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  40.08 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  38.86 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  36.29 
 
 		 428 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  38.43 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 431 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 440 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 440 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  32.84 
 
 		 448 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14810  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 425 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.342175  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0299  Homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  36.23 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  41.52 
 
 		 436 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  35.02 
 
 		 418 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  40.69 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>