More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2574 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
350 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  53.07 
 
 
353 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  52.84 
 
 
353 aa  299  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  31.87 
 
 
336 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  30.75 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  33.71 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  29.8 
 
 
346 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  30.68 
 
 
341 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  29.51 
 
 
346 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 
353 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  29.86 
 
 
337 aa  169  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  30.09 
 
 
341 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  30.17 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  29.23 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  31.5 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  35.36 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  29.6 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  33.72 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  29.89 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 
328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  29.89 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  33.99 
 
 
349 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  28.7 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  34.67 
 
 
335 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 
328 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  30.95 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  28.7 
 
 
337 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  28.41 
 
 
337 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  33.91 
 
 
328 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 
336 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 
330 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  31.73 
 
 
347 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  32.59 
 
 
340 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  32.2 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  31.73 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  34.9 
 
 
317 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  31.64 
 
 
374 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  30.68 
 
 
359 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  35.45 
 
 
350 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  32.27 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  27.21 
 
 
314 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  35.61 
 
 
319 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  29.51 
 
 
440 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  29.49 
 
 
436 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  33.06 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  31.28 
 
 
448 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  28.53 
 
 
431 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  35.32 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  28.25 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  27.68 
 
 
431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  28.25 
 
 
431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 
431 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  32.07 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  34.32 
 
 
428 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  31.7 
 
 
456 aa  113  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  29.83 
 
 
436 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  28.25 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  32.56 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  30.11 
 
 
435 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  32.52 
 
 
431 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  31.78 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  32.79 
 
 
431 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 
410 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  26.72 
 
 
431 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  32.11 
 
 
431 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  32.37 
 
 
440 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  31.3 
 
 
440 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 
427 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  33.2 
 
 
439 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  30.43 
 
 
431 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  28.65 
 
 
427 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  27.91 
 
 
428 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  30.66 
 
 
430 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 
437 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
431 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  31.45 
 
 
445 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  30.45 
 
 
426 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  32.77 
 
 
432 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
431 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
417 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
431 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
431 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
431 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
417 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 
430 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
431 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 
431 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  32.5 
 
 
432 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  31.56 
 
 
441 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  30.38 
 
 
433 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>