More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK2354 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  94.52 
 
 
347 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  94.81 
 
 
347 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  94.52 
 
 
347 aa  661    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  94.81 
 
 
347 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  90.14 
 
 
346 aa  627  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  90.43 
 
 
346 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  88.56 
 
 
341 aa  618  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  87.68 
 
 
341 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  80.65 
 
 
341 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  35.19 
 
 
342 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 
337 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.01 
 
 
336 aa  192  7e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 
337 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 
337 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
337 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 
355 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 
340 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  31.61 
 
 
353 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  31.5 
 
 
353 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  30.75 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  31.03 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  32.46 
 
 
336 aa  170  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 
353 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  31.76 
 
 
331 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  31.36 
 
 
429 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  29.89 
 
 
349 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 
314 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  31.07 
 
 
347 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  30.95 
 
 
328 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  30.61 
 
 
328 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  38.79 
 
 
431 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  30.9 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 
347 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  34.91 
 
 
328 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 
435 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  31.4 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  30.29 
 
 
359 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  29.75 
 
 
359 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  30.03 
 
 
374 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 
431 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  30.18 
 
 
436 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  30.47 
 
 
436 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  30.84 
 
 
432 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  32.15 
 
 
328 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  35.66 
 
 
439 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  30.14 
 
 
436 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 
436 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  32.46 
 
 
430 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  29.82 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  29.74 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  30.06 
 
 
428 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  27.75 
 
 
440 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  30.75 
 
 
427 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  29.23 
 
 
455 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 
436 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  28.14 
 
 
410 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  30.48 
 
 
441 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  29.39 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  29.33 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  29.22 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  33.06 
 
 
432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  29.11 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  28.11 
 
 
441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  30.21 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  29.17 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  28.93 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  30.52 
 
 
427 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  29.02 
 
 
428 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  30.79 
 
 
433 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  35.32 
 
 
418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 
432 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  27.68 
 
 
439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  30.03 
 
 
441 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 
432 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  27.51 
 
 
436 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 
417 aa  132  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  33.47 
 
 
452 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  29.74 
 
 
426 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  30.24 
 
 
431 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  29.74 
 
 
426 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  30.97 
 
 
434 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1361  Homoserine dehydrogenase  28.93 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.294507  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  30.33 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  33.2 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  30.24 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  30.21 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  30.56 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  28.32 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  30.24 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  29.76 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  29.94 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5333  homoserine dehydrogenase  32.63 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.767379 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  33.61 
 
 
440 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 
439 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>