More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1361 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1361  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 339 aa  669    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.294507  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2400  Homoserine dehydrogenase  58.7 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0610  homoserine dehydrogenase  52.17 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.123069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 427 aa  218  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  45.08 
 
 		 455 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  44.28 
 
 		 437 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 432 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 431 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  45.74 
 
 		 445 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  45.43 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  41.85 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  42.32 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  43.93 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 431 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  44.3 
 
 		 435 aa  202  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 		 430 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 431 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  36.54 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  38.56 
 
 		 436 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  39.47 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 448 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2298  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.11 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  44.3 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  36.06 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  36.13 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  38.56 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  38.56 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 431 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.99 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 441 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  37.85 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  42.5 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  41.72 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11321  homoserine dehydrogenase  45.11 
 
 		 441 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  37.32 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 436 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  34.9 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.81 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  44.17 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4348  homoserine dehydrogenase  43.89 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359179  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  37.66 
 
 		 426 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1607  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  37.9 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 436 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  34.81 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.38 
 
 		 442 aa  182  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  35.14 
 
 		 438 aa  182  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 		 438 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  37.42 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  34.38 
 
 		 739 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 441 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  35.73 
 
 		 720 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 439 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  37.81 
 
 		 434 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 428 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  42.38 
 
 		 430 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  42.57 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  35.74 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  44.41 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  38.77 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 440 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  38.36 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  36.92 
 
 		 436 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>