More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0610 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0610  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 320 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.123069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1361  Homoserine dehydrogenase  52.17 
 
 		 339 aa  288  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.294507  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2400  Homoserine dehydrogenase  50.62 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  41.36 
 
 		 424 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 436 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 		 432 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 432 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 		 430 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 431 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 430 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 431 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 431 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.61 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  38.7 
 
 		 436 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  38.36 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  41.64 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 429 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 435 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  39.56 
 
 		 427 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 430 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 436 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.9 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  38.54 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 		 441 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  38.54 
 
 		 431 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.62 
 
 		 430 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  37.9 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  37.25 
 
 		 423 aa  186  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  40.63 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.08 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  36.08 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 433 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  35.42 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  34.83 
 
 		 426 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 		 436 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 418 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  37.62 
 
 		 448 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  37.12 
 
 		 438 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  36.89 
 
 		 440 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 430 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 		 438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  41.35 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  41.25 
 
 		 437 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 431 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  34.95 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  34.95 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  38.54 
 
 		 435 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  38.29 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  36.92 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  34.73 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  37.42 
 
 		 440 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  36.92 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  39.42 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 		 440 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.92 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  38.49 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  41.48 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 444 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  40.29 
 
 		 442 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 		 428 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  39.88 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  35.02 
 
 		 430 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 463 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 428 aa  175  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 437 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  33.65 
 
 		 441 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 438 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>