More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0390 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  100 
 
 
720 aa  1435    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  97.64 
 
 
739 aa  1405    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  44.44 
 
 
427 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  45.54 
 
 
411 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  45.79 
 
 
411 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  45.54 
 
 
411 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  45.54 
 
 
411 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  44.94 
 
 
410 aa  347  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  45.3 
 
 
410 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  46.31 
 
 
412 aa  343  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  46.31 
 
 
412 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  44.2 
 
 
405 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  45.32 
 
 
413 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  45.07 
 
 
424 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  44.8 
 
 
411 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  44.5 
 
 
401 aa  340  5.9999999999999996e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  43.7 
 
 
405 aa  339  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  43.7 
 
 
405 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  43.21 
 
 
426 aa  338  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  44.31 
 
 
413 aa  336  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  44.39 
 
 
412 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  44.64 
 
 
407 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  43.61 
 
 
399 aa  335  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  44.47 
 
 
409 aa  334  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  43.78 
 
 
427 aa  334  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  44.72 
 
 
404 aa  333  5e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  43.11 
 
 
399 aa  333  6e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  42.96 
 
 
411 aa  332  1e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  44.58 
 
 
408 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  42.04 
 
 
434 aa  331  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  43.11 
 
 
400 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  43.41 
 
 
424 aa  330  6e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  42.61 
 
 
400 aa  330  6e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18571  aspartate kinase  42.62 
 
 
586 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  42.51 
 
 
408 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  42.86 
 
 
400 aa  329  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  47.25 
 
 
409 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  43.78 
 
 
400 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  42.12 
 
 
406 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  44.69 
 
 
412 aa  326  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  44.2 
 
 
413 aa  325  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  46 
 
 
410 aa  324  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18381  aspartate kinase  41.89 
 
 
586 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  43.56 
 
 
406 aa  323  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1740  aspartate kinase  41.55 
 
 
586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  45.64 
 
 
404 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  44.94 
 
 
406 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  43.67 
 
 
410 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  43.87 
 
 
408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  44.36 
 
 
400 aa  320  5e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  44.09 
 
 
409 aa  320  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  44.39 
 
 
422 aa  320  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  43.2 
 
 
422 aa  320  7.999999999999999e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  42.22 
 
 
405 aa  319  9e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  42.43 
 
 
405 aa  318  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  44.36 
 
 
409 aa  317  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  42.26 
 
 
422 aa  317  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  42.29 
 
 
403 aa  317  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18381  aspartate kinase  40.66 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  42.25 
 
 
435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  43.1 
 
 
420 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  42.54 
 
 
405 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  40.99 
 
 
599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1711  aspartate kinase  42.51 
 
 
406 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  42.03 
 
 
424 aa  313  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  43.66 
 
 
407 aa  313  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  42.54 
 
 
407 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  42.57 
 
 
404 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  42.79 
 
 
405 aa  313  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  39.86 
 
 
428 aa  312  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  42.72 
 
 
424 aa  313  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  42.72 
 
 
409 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  44.36 
 
 
421 aa  312  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  41.94 
 
 
409 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  39.29 
 
 
428 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  43.31 
 
 
421 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  41.65 
 
 
599 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  42.3 
 
 
421 aa  311  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  43.84 
 
 
408 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  43.84 
 
 
408 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  43.1 
 
 
424 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  41.87 
 
 
440 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  43.49 
 
 
411 aa  310  6.999999999999999e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00821  aspartate kinase  43.13 
 
 
595 aa  310  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  42.33 
 
 
416 aa  310  9e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  41.83 
 
 
424 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  41.77 
 
 
421 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  42.96 
 
 
410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0976  aspartate kinase  41.67 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1965  aspartate kinase  39.21 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0866474  hitchhiker  0.000866025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  42.51 
 
 
414 aa  308  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  41.83 
 
 
414 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  42.26 
 
 
422 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  41.51 
 
 
601 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  42.17 
 
 
452 aa  306  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  41.65 
 
 
599 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  42.08 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  41.5 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  42 
 
 
446 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  41.03 
 
 
421 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>