More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0845 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 335 aa  671    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  55.45 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  50.76 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  49.4 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  48.65 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  50 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  49.7 
 
 		 337 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  47.62 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  46.79 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  42.2 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 353 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  38.51 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  37.77 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 436 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 		 347 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 		 431 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  37.72 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.64 
 
 		 431 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.42 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.64 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  37.98 
 
 		 439 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 439 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.04 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.04 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  36.61 
 
 		 439 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 		 441 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 		 426 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  37.98 
 
 		 439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  35.23 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 429 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  35.23 
 
 		 359 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.03 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  36.18 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  37.03 
 
 		 431 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.99 
 
 		 431 aa  185  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 431 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 430 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 		 444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  33.72 
 
 		 449 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.62 
 
 		 436 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  34.59 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  42.5 
 
 		 440 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  41.77 
 
 		 440 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  43.91 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  34.97 
 
 		 432 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  43.91 
 
 		 441 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 447 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  35.36 
 
 		 432 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  35.13 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 433 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 436 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  34.3 
 
 		 436 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  34.58 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  34.12 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>