More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0506 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  673    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  43.66 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  44.25 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  41.21 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  41.21 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  40.63 
 
 		 374 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  40.48 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  36.69 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  37.72 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  34.76 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 432 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  37.25 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  35.77 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 436 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 431 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  35.42 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  36.8 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.74 
 
 		 440 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  32.53 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 430 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  32.46 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  32.46 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  33.72 
 
 		 425 aa  172  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  32.16 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  32.16 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 431 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  33.73 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 440 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  36.69 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  32.46 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  32.84 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  37.32 
 
 		 435 aa  169  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  36.18 
 
 		 428 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  39.47 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  32.54 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1055  Homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0998608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  35.35 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  35.17 
 
 		 438 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 342 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  31.94 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 		 435 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  36.04 
 
 		 433 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  42.68 
 
 		 435 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1790  Homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  32.04 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  32.93 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  31.64 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>