More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1704 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 337 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  94.96 
 
 		 337 aa  643    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  95.24 
 
 		 337 aa  640    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  81.85 
 
 		 337 aa  549  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  75.98 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 331 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  49.7 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  49.84 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  42.39 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  41.62 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  41.62 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  38.71 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  38.71 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 347 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  37.87 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  36.69 
 
 		 349 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 		 436 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  39.18 
 
 		 435 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  35.57 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 449 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  33.92 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  35.94 
 
 		 438 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.52 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 439 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.01 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 431 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 440 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 		 431 aa  185  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 		 431 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  34.91 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 		 439 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  35.38 
 
 		 436 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  35.94 
 
 		 431 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 436 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 440 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  33.94 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  35.59 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  35.49 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 438 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  35.1 
 
 		 439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 436 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  35.36 
 
 		 431 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 439 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>