More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2003 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 317 aa  640    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  52.23 
 
 		 314 aa  338  5e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 355 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 353 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.74 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  35.45 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  33.94 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  33.94 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  33.23 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.89 
 
 		 440 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0949  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.949052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 		 441 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 441 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  35.49 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  34.06 
 
 		 440 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  34.13 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  32.51 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  36.01 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  33.9 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0271  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.508007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  33.54 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  34.37 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  31.58 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  34.06 
 
 		 439 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  34.06 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  33.64 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0379  homoserine dehydrogenase  35.02 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.768095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  32.34 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  31.94 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  32.83 
 
 		 435 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  33.23 
 
 		 720 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  31.89 
 
 		 340 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 415 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  29.76 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  33.97 
 
 		 739 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.95 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  32.83 
 
 		 440 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 435 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 433 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  32.37 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  34.65 
 
 		 440 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 439 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  32.72 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  33.54 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  34.76 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 		 438 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  33.23 
 
 		 410 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  32.72 
 
 		 436 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  33.74 
 
 		 431 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  36.22 
 
 		 437 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1842  homoserine dehydrogenase  32.81 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  33.94 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  30.72 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  32.61 
 
 		 431 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  33.74 
 
 		 431 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  30.91 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  30.72 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  35.11 
 
 		 438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  30.96 
 
 		 428 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  32.66 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  34.06 
 
 		 429 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 431 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  33.02 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  31.08 
 
 		 441 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.93 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  32.93 
 
 		 438 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  32.42 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  32.41 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>