More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0379 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0379  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.768095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0949  homoserine dehydrogenase  61.29 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.949052 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0271  homoserine dehydrogenase  62.5 
 
 		 303 aa  364  1e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.508007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1842  homoserine dehydrogenase  62.09 
 
 		 303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  36.99 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  37.96 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  34.7 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  34.23 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  35.02 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 336 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  35.04 
 
 		 353 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  34.38 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 		 340 aa  142  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  32.93 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  33.72 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  34.12 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 427 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  37.08 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  35.97 
 
 		 431 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  32.02 
 
 		 439 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  37.23 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  35.55 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  34.09 
 
 		 431 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.4 
 
 		 431 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  35.98 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.4 
 
 		 431 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 431 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 		 426 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 		 426 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.4 
 
 		 431 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.4 
 
 		 431 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.4 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.4 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.4 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  32.08 
 
 		 428 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  33.88 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  30.34 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.13 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  36.91 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  32.22 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  35.66 
 
 		 428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  32.59 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  32.82 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.03 
 
 		 436 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  32.47 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.27 
 
 		 441 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  33.47 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  37.29 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  32.44 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  34.58 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  32.35 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  32.77 
 
 		 436 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  35.06 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  32.54 
 
 		 438 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  28.83 
 
 		 438 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  31.54 
 
 		 427 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  32.38 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  34.03 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  35.04 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 		 435 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  31.51 
 
 		 436 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  31.37 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  33.06 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  28.79 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  35.13 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  34.03 
 
 		 436 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  34.89 
 
 		 452 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  30.34 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  34.03 
 
 		 433 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  34.32 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  33.48 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  32.52 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>