More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0969 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  95.24 
 
 		 337 aa  640    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  96.73 
 
 		 337 aa  650    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 337 aa  671    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  81.01 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  75.68 
 
 		 340 aa  521  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  50.3 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  49.85 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  51.64 
 
 		 335 aa  292  5e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 328 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  38.87 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  39.71 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  37.08 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 436 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  39.45 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 429 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 		 418 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 436 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 		 436 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 441 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 		 449 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 438 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  38.1 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 439 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.8 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 432 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 436 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 417 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  32.45 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 441 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.12 
 
 		 430 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  35.38 
 
 		 439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 431 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  35.05 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  35.21 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 		 439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  32.84 
 
 		 428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  43.04 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  33.94 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 447 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  35.67 
 
 		 439 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  35.86 
 
 		 436 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 436 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  34.41 
 
 		 440 aa  178  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  34.41 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>